技術(shù)文章
Technical articles羅氏LightCycler® 480 實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)是實(shí)驗(yàn)室中常用的一款中高通量qPCR平臺(tái)。以下是其標(biāo)準(zhǔn)的使用步驟流程,適用于絕大多數(shù)使用SYBR Green或TaqMan探針進(jìn)行核酸擴(kuò)增和定量分析的場(chǎng)景:
核酸提取
提取DNA或RNA(如為RNA需進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA)
評(píng)估濃度與純度(建議A260/A280介于1.8–2.0)
試劑準(zhǔn)備
根據(jù)實(shí)驗(yàn)方案選擇合適的qPCR試劑(如SYBR Green I Master、Probe Master)
準(zhǔn)備引物/探針工作液,確保無(wú)氣泡、低溫避光保存
標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系(以20 µL體積為例):
成分 | 體積(µL) |
---|---|
Master Mix | 10 |
Forward Primer (10 µM) | 0.4 |
Reverse Primer (10 µM) | 0.4 |
探針/染料(如適用) | 0.2 |
模板DNA/cDNA | 1–2 |
無(wú)RNAse水 | 補(bǔ)足至20 µL |
注意:
所有反應(yīng)成分應(yīng)在冰上配置;
引物濃度通常在0.2–0.5 µM之間;
若使用多重qPCR,請(qǐng)確保熒光通道互不干擾。
將反應(yīng)混合液分裝至96孔或384孔反應(yīng)板中;
使用專(zhuān)用光學(xué)封板膜密封反應(yīng)板;
輕壓封膜并離心去除氣泡(例如2000 rpm × 30秒);
插入LightCycler® 480中指定托架位置。
在LightCycler® 480 Software中設(shè)置PCR程序,以下為常用的SYBR Green法設(shè)定模板:
預(yù)變性:95°C, 10 min
循環(huán)階段(40–45 cycles):
變性:95°C, 10 sec
退火:60°C, 20 sec(具體溫度依引物而定)
延伸:72°C, 20 sec(有時(shí)與退火合并)
熔解曲線分析(如用SYBR Green):
95°C, 5 sec
65°C–95°C逐步升溫,每步0.5°C,采集熒光
熒光采集通道:根據(jù)染料選擇通道(如FAM通道用于SYBR或FAM-TaqMan探針)
確認(rèn)熱蓋溫度(一般為105°C);
啟動(dòng)程序運(yùn)行,期間可實(shí)時(shí)觀察擴(kuò)增曲線;
運(yùn)行時(shí)間約為1.5–2小時(shí)(視程序設(shè)定而定);
擴(kuò)增曲線查看:確認(rèn)每孔反應(yīng)特征,是否存在拖尾、背景信號(hào);
Ct值判讀:導(dǎo)出或自動(dòng)生成Ct結(jié)果表;
熔解曲線分析(SYBR Green):判斷特異性與是否出現(xiàn)非特異擴(kuò)增;
標(biāo)準(zhǔn)曲線法(如絕對(duì)定量):生成曲線并計(jì)算拷貝數(shù);
表達(dá)量分析(如相對(duì)定量):使用ΔΔCt法比較表達(dá)差異;
可導(dǎo)出 .xls
, .pdf
, .xml
等格式結(jié)果;
保存完整項(xiàng)目用于追溯和后續(xù)分析;
建議同時(shí)備份至本地和實(shí)驗(yàn)室服務(wù)器。
每次使用后清理反應(yīng)板托盤(pán);
定期進(jìn)行光路校準(zhǔn)與溫控驗(yàn)證;
每月檢查熱蓋壓力與熒光通道響應(yīng);
若長(zhǎng)期不使用,建議進(jìn)行關(guān)機(jī)保護(hù)處理。